最初に私が返信しました内容がうまく伝わっていなかったかもしれないのと、かなり端折って返信していましたので、端的に、かつ補足しつつ返信してみますね。
>≪予想ファイルサイズ≫が全くあてにならなくて困っています。
→ハードウェアエンコーディングを超低ビットレートで使用しているのが原因だと思います。
>スライドによっては細かな字（最小10ptくらい）があります。これが判読できるレベルで一番適した圧縮方法をご教授いただけたら有難いです。
→4K 25fpsで、素材のファイルサイズより極端に大きくしたくない場合には、VBR 2Pass（自動的にエンコーダーはハードウェアからソフトウェアに切り替わります）にて、ターゲットビットレートを1Mbps、最大ビットレートを20くらい、そしてキーフレームの間隔を50程度に設定するとよいと思います。
※ただし、動画中に実写映像が含まれる場合や、場面転換に動きのあるエフェクトがある場合には、その部分でやや破綻がみられるかもしれません。
以下補足説明です。
CBR 1Mbpsで書き出したファイルより3Mbpsで書き出したファイルのほうが小さくなってしまった原因は、操作のミスではなく、使われているハードウェアエンコーダーの特性という捉え方でよいと思います。
一般論とまでは言いにくいのですが、今回のような超低ビットレートで書き出すケースでは「ハードウェアエンコードは適していない」とお考えいただくとよいのではないかと思います。
「ソフトウェアエンコーディング」を選んでいただきますと、ほぼ計算通りのファイルサイズで書き出されると思います。ハードウェアエンコーディングと比べ、CBR 1Mbpsの画質はほぼ同じ（あまりよくない状態）だと思いますが、CBR 3Mbpsのほうは多少画質が良くなると思います。
CBRはその名の通りビットレートが一定で書き出しのファイルサイズが理屈の上では計算通りになり、帯域制限のある伝送に適した形式ですが、H.264自体厳密にはCBRにはならず無駄な詰め物（ビットレートを一定にするための画質に貢献しないダミーのデータ）が発生することもしばしばで、画質の面ではあまりよくありません。
特別な意図がない限り、VBRのほうが良いと思います。
VBRの1Passは、ターゲットビットレートに収まるように考慮しつつ映像の複雑さに合わせてビットレートを変動させますが、エンコーダー的には一発勝負なので映像の内容次第では当てが外れてビットレートが想定とかけ離れることがあります。
（Premiere ProのVBR 1Pass書き出しは、比較的ハズレが少ないようには思います。）
2Passであれば、いったん映像全体を解析してどこにどれだけビットレートを割り当てればよいか正確に計算できるので、書き出し後のファイルサイズが予測値と一致しやすくなります。
（結果的に、同じビットレートでは画質の面でも有利になることもあります。）
そういった諸々を考慮しまして、画質をあまり落とさず、かつファイルサイズを小さくしたい場合には、VBR 2Passにて、ターゲットビットレートを1Mbps、最大ビットレートを20くらい、そしてキーフレームの間隔を50程度に設定するとよいと思います。
最後に、素材のファイルのビットレートについてですが、おそらく素材のファイルは普通の視聴には何ら問題ない程度に十分に綺麗な映像だと思います。
ファイルサイズが4K 25fps で780MBというのは動画としては非常に低ビットレートではあるのですが、単純に低ビットレートで録画したからファイルサイズが小さくなった、というわけではない可能性があることに注意が必要です。
例えば、静止画が30秒あったとしますと、3840ｘ2160の画像が750枚で構成された動画ではありますが、1枚だけ保存して残りの749枚はその1枚をずーっと表示しておけば良いという理屈になります。この時点で、ファイルのサイズは1/750もの圧縮が画質は無劣化で行えるということになります。
実際にはその理屈通りではなく、H.264の圧縮パラメーターはほとんどの場合非可逆圧縮で品質を一定値に制限しているわけですが、プレゼンのスライドなど静止画が多い映像は、とてもファイルサイズが小さいにもかかわらず映像は十分キレイなことが多いです。
また、画面録画の場合フレームレートがCFRではなくVFRであることも多いように思います。同じ画質ですと多少ファイルサイズがおおきくなってしまうのですが、編集前提の場合にはCFRで収録していただいたほうがトラブルは少ないです。
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