パスワードプロテクトでプリント禁止ならアクションウィイザードだけでバッチ処理を書くことができますが、あえてJavaScriptで書くとしたら…
①あらかじめ必要なプロテクトを適用するためのセキュリティーポリシーを設定しておく。
②JavaScriptでそのポリシーを適用する。
という流れが扱いやすいでしょう。セキュリティポリシーを取扱うにはFolderレベルでのアクセスが必要になるのでメニューに組み込むかアクションウイザードで利用することになります。ということなので、素直にアクションウイザードで処理するのが良いのですが、どうしてもJavaScriptでって言うのであれば…
security.getSecurityPolicies()でAcrobat上に設定されているセキュリティポリシーを検索して、そのうちの必要なものをthis.encryptUsingPolicyメソッドの引数としてoPolicyに当てて適用します。
詳しいことは以下のドキュメントをお読みください。
https://opensource.adobe.com/dc-acrobat-sdk-docs/library/jsapiref/doc.html#encryptusingpolicy
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