PDFファイルで100％以下の領域を持つ色の確認方法

いったんグレースケールにしたい、ということでもないと思うのですが、どのような条件でヒットさせたいのかが少々不明瞭ではないかと思います。

それとは別に、Acrobat の利用とした場合、それ自体が2015年にはサポート終了してるものなので、現時点で使うことそのものがリスクです。

それとは別にですが、プリフライトはDC 2015以降で相応に強化されているので、その点も考えたほうがいいでしょう。

もちろん、今から契約するならDCサブスクリプションに限るところです。

まずはご使用の環境を。古い環境なのか最新の環境なのかがわかりません。Acrobat Proですか？

また、「解析結果」と書かれていますが、具体的にどの機能を使って、どのような手順で解析しているのでしょう。

諸々明記されたほうがよい回答が付きやすいのでオススメです。