PDF内の検索機能について

PDF内の文字が縦組の状態であっても、文字列検索ができるかどうか、といえば、通常は可能です。

ただ、InDesignやIllustrator以外のアプリケーションやPDF生成方法次第では、1文字単位の横組みになる場合があるので、その場合は正常に検索できない可能性はあります。

ここは実際に生成したPDFを用いて確認されたほうがいいと思います。