Creative Cloud Desktop アップデートは、すべてのアプリもアップデートする認識でよろしいでしょうか？

デスクトップアプリのアップデートと各アプリケーションのアップデートは別になっています。

環境設定としても、それぞれ異なっています。

• デスクトップアプリ：一般タブの「Creative Cloudを常に最新に保つ」の設定で自動アップデート処理
• アプリケーション：アプリタブの「自動更新」の設定によって自動処理されるかが変わる

これとは別に、Acrobatは独自のアップデート処理を行い、デスクトップアプリの設定とは連動してません。

そのため、Windows版Acrobatに含まれるAdobe PDFプリンタードライバーは、バックグラウンドでのアップデートで設定がデフォルトに戻るようなことがあり、意図しない変化になる場合があるようです。