ADOBE FONTSとMACのFont Bookの相性は大丈夫でしょうか？

macOSのシステム環境設定で新規の管理者アカウントを作成し、そちらでも確認を行ってみてください。

そちらで正常であれば、アカウント情報の破損です。

破損については修復することは実質的に不可能になるので、新アカウント側での運用に切り替えることになります。

単に FontBook の不具合のように思います。プリセットファイルを作り直して改善しないかしら？
　～/Library/Preferences/com.apple.fontbook.plist
　～/Library/Preferences/com.apple.ATS.plist

AdobeFonts の仕組みに詳しいわけではないので的外れかもしれませんが，FontBook は AdobeFonts のフォントファイルにアクセスできないですし，CreativeCloudDesktop が FontBook に干渉することも考えにくい（見聞きしたことがない）ですし AdobeFonts は関係ないように思います。
例えば，CreativeCloudDesktop を起動項目から外した場合には FontBook で全フォントがアクティベートされた状態だったりするのでしょうか？