PDF書き出し　マスターが変わってしまう

CS6を使用しています。

InDesignからPDFに書き出しすると、あるページだけマスターが変わってしまいます。

マスターはA・B・C・D・Eの5種類

左綴じ28ページもので、P.1~8（Aマスター）　P.9～10（Bマスター）　P.11～12（Cマスター）　P.13～14（Dマスター）　P.15～（Eマスター）

※表紙はP.00、開いた見開き左がP.1になります。

マスターが変わってしまうのは、Eマスターを割り当てているページ。

PDFに書き出すと、Aマスターで書き出されてしまいます。

InDesignのオーバープリント表示にした場合→InDesignのプリントアウト状態と同じでPDFの書き出しとは違います。

左右で違うマスターを使用しているページはありません。

ちなみに、15ページ以降を全てまたは単ページをPDFに書き出すと、Eマスターの表示で書き出せます。

同様に、11ページ以降・13ページ以降を書き出したときも正常でした。

ところが、9ページ以降で書き出すと、Eマスターを割り当ててあるページが、Bマスターになって書き出されてしまいました。

このような現象が起こると、どうして良いかわかりません。

今回のようにページ数が少なければマスターを作り直すこともできますが、ページが多いとそうも行きません。

PDFに書き出すのは入稿間近が多いので、時間的な問題もあります。

このようになったのは、今回が初めてです。

解決策、もしくは原因がおわかりになる方、宜しくお願い致します。