ページ数を消してしまった

どのようなレイアウトなのかわかりませんが、

テキストがページ間で連結されている（前のページで文字が増減すると後のページにも影響する）状態の場合、ページ数は変わっていなくてテキストが溢れている状況かもしれません。

一番最後のページのテキストフレームに、こんな赤いマークがあれば、テキストが溢れているしるしです。

>他のページにはナンバーと、教材名は残っていますがクリックしても反応しない

「ページ」パネルを出して、そのページのサムネイルについたアルファベットを確認してください。

そのアルファベットは、適用されたマスターページを表ています。

「A」の場合、「A」のついたマスターページをカチカチして、マスタースプレッドを表示させると同じ部品があるはずです。そこからコピペできるでしょう。

>真ん中に分ける線

一般に考えると見開きページの区切り線は見えなくならないのですが、おそらく見開きサイズの単ページに見開きのレイアウトをしている可能性を考えます。

その場合は上記と同じでマスターページから部品をとってください。

今回は編集を頼まれたとのことですが、作ることろからではもっと直しやすい作り方がありそうな雰囲気なので、もし作る担当になった際は基礎的なところを覚えてみるとよいです。

仕事の依頼主におたずねされるのが早いのでは？