メディアエンコーダーで書き出すと色が変わる

追加の情報ありがとうございました。

添付していただいた2枚の画像を拝見しているのですが、高輝度部分の彩度に若干の違いが見られますものの、ほとんど同じように見えます

おそらくiPhoneのHDR動画を扱っている状況かと思うのですが、もう少し情報があった方がありがたいので、こちらのリンク先をご参照いただきつつ、お使いのパソコン（Macでしょうか？）の種類やOSのバージョン、そしてPremiere ProとMedia Encoderのバージョンをお知らせいただけますと、より的確な返信が付きやすくなると思います。

【質問テンプレート】コピペして使ってください☺︎ (https://community.adobe.com/) 

私自身はiPhoneユーザーではあるものの、HDRで撮影することができない機種なので正確な検証はできないのですが、代替できる手段などを用いてできるかぎりの検証はしてみようと思います。

>またPremiere Proに４ｋ動画を入れてからメディアエンコーダーに入れて圧縮すると縦動画に限り縦に圧縮されてしまいます。

iPhoneの素材は、基本的にはそのままPremiere Proに読み込ませて編集しても大丈夫なはずなので、この点についてはどこかで設定に誤りがある可能性もあると思います（もちろん、特定の状況下での「バグ」の可能性もありますが……）。

もし差支えございませんでしたら、Premiere Proで縦長動画が圧縮されてしまう状況での、「シーケンス設定の画面」、「書き出し設定の画面」、「縦に圧縮された状況が分かる画面」などを、権利モノや個人情報などの映り込みにお気をつけ頂きつつスクリーンショットで添付していただけますと、色の問題も含めて一気に解決できる可能性があります。