Exporter un pdf via indesign en gardant les calques séparés

Bonjour, je dois créer un projet sur illustrator ou indesign avec cutcontour pour traits de coupe personnalisé, il faut donc que j'exporte mon projet en pdf avec calques séparés (calque projet + calque cutcontour en surimpression) pour qu'à l'impression il y ai juste le calque projet qui soit imprimé, mais ça ne marche pas.

En gros mon pdf s'exporte mais en un seul calque, avec dedans mes deux calques mais en mode sous claques. Ce qui est inexploitable. J'ai suivi le tuto adobe mais rien n'y fait.