PDFデータのテキスト部分をコピーして、メモ帳貼り付けると、文章が逆転しまう現象

そのPDFはどのようにして作られた物でしょうか？

データの形式（タテorヨコ組み・文書なのか表なのかなど）はどのような形でしょうか？

ご質問の件はタテ組の文章の場合に起こりやすい現象だと思います。

いずれにせよPDFからのテキスト取り出しはベストエフォート型（やれるだけやってみる）であり、予期せぬエラーが出る場合があります。

ふちのついている文字を二重で取ってしまう。画像認識（OCR）すると「一（漢字のいち）」を「ー（長音付）」と誤認してしまう。などが確認されています。

100％アテにされるのは危険と認識ください。

PDF ファイルからテキストおよび画像を抽出する方法（Acrobat DC）

こういう方法もあります。割と正確にできるみたいですよ。