国税庁　確定申告書等作成コーナーより出力されたPDFがAdobe acrobat readerにて白紙表示され閲覧ができない。ファイルからではなく直接Adobe acrobat readerを開いた場合、履歴内に無いため、開いた扱いになっていないものと考えられる。国税庁から取得したPDFのみこの現象は発症し、通常作成されたPDFに関しては正常に動作する。

実際にどのような環境（OSやReaderのバージョン）でしょうか。
当方の環境（Windows 11 25H2、Acrobat Pro 64bit/Acrobat Reader 32bit ともに2025.001.21184）についてでいえば、当方が国税庁の確定申告書のサイトで2026年1月24日に作成した、令和07年分の申告諸島送信票や、令和元年/2年に作った過去分については表示できています。

国税庁のサイトで作成されたPDFはいわゆる互換エンジンを使ったものなので、場合にってはAcrobat製品ではうまく表示できないことはあったりします。
その場合はChromeなどのWebブラウザで表示させるなどで回避できることはあります。

ただ今回の場合、もしかしたら該当のPDFそのものが破損しているという可能性もありそうに思います。
そうなると再度国税庁のサイトで作成・出力が必要かもしれません。