エンコード残り1秒からマルチプレクサの処理が始まることについて

Premiere pro 2022から、MediaEncoderにキュー出しして映像を出力しています。この際、H.264やH.265などで書き出すと、音声と映像を一旦別に出してあとでMP4のコンテナにマルチプレクスしているかと思います。

その際、出力されたデータが100GBほどあると終わらない（ように見える）現象が発生してしまいます。タスクマネージャーから確認すれば、動作していることは確認できますが…。VMe SSD のPCIe4.0接続でも30分ほど、2.5インチHDDだと12時間ほどかかっています。

これをエンコードの終了予測時間に盛り込むことは出来ないのでしょうか？または、分けて出力しないことは出来るのでしょうか？

お手数ですが、ご教示いただけますと幸いです。

スペック

Windows10 Pro

CPU：Intel Core i9-19200ks

GPU：NVIDIA RTX3090Ti

RAM：DDR5-4000 128GB

出力プロファイル

H.265　ハードウェアエンコード

30分　450Mbps（100GB前後）

マルチプレクサー　MP4