アラート「スマートオブジェクトファイルプログラムエラーです。　を更新できません」

もちろんです。

一般的なトラブルシューティング、自分に思い当たる範囲の事を行なって変わらないのでなければ

尋ねません。

まず他の人にも再現性の有るエラー（＝保証外のため仕方ない事）なのか、

自分にだけ起こる現象（＝自分の環境に問題が有る）を絞れていないので、

そこを確認したいですね。

一般的なトラブルシューティングは試されているのでしょうか。

おかしいなと思ったら：Photoshop CS6/Photoshop CS6 Extended

ただ、いずれにしても動作保証外なのには変わりはないですし、

一般的にはOSバージョンがかけ離れるほど互換性は低くなることを踏まえることは前提にはなります。

Photoshop に限らず CS6 は Mojave では動作保証外なので、エラーが出るのはある程度仕方ないことなんですが、実際にどのような操作をした場合にエラーが出るのかいまいちわかりません。

Mojave で CS6 も使っていますから実際に行なっている動作を教えていただけば検証してみます。

-- silk-m