２０１８にアップデートするとプラグインしていたソフトが表示されない　どのようにすれば良いのでしょうか

当該プラグインの動作対象にCC (2018) が含まれるかどうか知りませんが、

一般論として Photoshop CC をバージョンアップしてもプラグインは自動では引き継がれないので

C:\Program Files\ もしくは C:\Program Files(x86)\ の下の

Adobe\Adobe Photoshop CC (2017)\Plug-ins の中身を

同 Adobe\Adobe Photoshop CC (2018)\Plug-ins に手動でコピーする必要があります。

そのために、CC (2018) にバージョンアップすると CC (2017) のファイル群は削除されますが

Adobe\Adobe Photoshop CC (2017)\Plug-ins だけは削除されずに残っています。

CC 2018は別バージョンのプログラムなので、必ずしも引継ぎされるわけではありません。

そもそもNik CollectionはAdobe製品ではないですし、ここで質問するものでもないと思います。

あわせて、Nik Collectionは公式にはCC 2015までしか記載がないので、動作保証されないんじゃないでしょうか。