3Dレイヤー化したシェイプの移動アニメーションについて質問です。

３Dに切り替えて自動方向にすると、カーブで捻れるような動きになるので、カーブの半径が小さいとオブジェクトが反転してしまったと思います。
カーブの緩い箇所で確認すると、下図のように変化しています。

自動方向のオプションでカメラの方向に向けるようにするか、または、自動方向を使わずにテキストレイヤーの状態でパスに沿わせるようにようにすれば、３Dでも反転しません。

参考ですが、過去にCS6のカメラトラッカーのデータから作成したモーションパスを３Dソフトのオブジェクトにするとカーブの外側に捻れていました。
今回のパスのデータも、テキストがカーブの外側に回転しています。