m4aデータが再生できない

添付画像を拝見しますと、マルチチャンネルのうち3チャンネルにのみ波形があるように見えます。

おそらくヘッドホンの左右に1チャンネルと2チャンネルがアサインされているので、3チャンネルが聞こえない、という状況ではありませんでしょうか？

（今手元の環境で確認できないのですが、環境設定のオーディオチャンネルのマッピングで変更できるのではないかと思います。）

最終的に2チャンネルステレオでお使いになる場合には、マルチチャンネルからステレオに変換してしまうのもひとつの方法かと思います。