レイヤーパネルで現在選択している（複数）レイヤー等を一発でリネームするスクリプトを作りたい。

ExtendScriptでは不可能ですね…

アートボード上で選択したオブジェクトから辿るしかなさそうです。

>Itemを選択していた場合にそれが取得できませんでした

ここがよくわからなかったのですが、「レイヤーパネル上でオブジェクトを選択（アートボード上では選択状態にならない、ハイライトさせただけ）」という意味だったでしょうか？

名前のある広いところの代わりに、右端の◯のさらに右の空きをクリックすれば、パネル上だけでなく実際に選択されたオブジェクトとなります。マウス操作がほんの少しこまかくなるだけで、手数（てかず）は変わりません。

それで運用してはどうでしょう？

以下余談ですが、activeLayerはあてにしないほうがよいです。

例として、alert(app.activeDocument.activeLayer.name); を実行した結果のスクショ２つです。

違いがわかるでしょうか。

オブジェクトが何も選択されていない状況で、レイヤーパネル上で複数のレイヤーをshiftキー併用でハイライトさせた場合の、最後にハイライトされたレイヤーがactiveLayerとなるです。

もう１つ出します。

これは、①レイヤー2をハイライト ②レイヤー4をshiftクリック（挟まれたレイヤー3も含めてハイライトされる）③レイヤー4を⌘+クリック（Windowsならctrl+クリック）してハイライト解除

してactiveLayerを取得したものです。これでもレイヤー4が返ります。

最後にもう１つ。

オブジェクト選択後に、上記①-③と同じ手順を踏んだものです。

そんなかんじです。