aiデータだけ色味が違う

RGB入稿を許容している先でしょうか。

PNG自体がRGBのみですし、aiデータの作成がCMYKカラーモードであれば、出力時のPDF設定と相まることを前提にCMYK変換される可能性があるわけなので、そうなると色味は変わってしまいます。

RGBを許容する先ならRGBカラーモードのまますべて完結させる必要があります。

ただ印刷は通常、CMYKプロセスカラーが基本なので、RGB→CMYK変換がどこかで必ずかかり、印刷時の影響は出る可能性があります。

その点なども含めて大丈夫か、というのはあります。

Canvaも基本はRGBであることと同時に、あまり詳細なコントロールができないツールですから、その点は割り切り等も必要です。

ドキュメントのカラーモードや画像のカラープロファイルの扱いに違いがあるのかな？　ちょっとわからないです。

質問文の「2種類のデータを同じように作成し、／ ・元の画像（PNG）／ ・aiデータ ／ ・PDFデータ ／ の３種類で保存した」の部分の意味が，私にはよくわからなかったです。わかる人もいるとは思いますけど，もう少し具体的に書いていただけるとありがたいです。

それと，その3種類のデータの色をどのように確認しているのか（それぞれ何のアプリケーションで開いているのか等）は書かれたほうがよいと思います。