AfterEffectsのレイヤーモードについて

平面の色は黒にしていますか？

試してみましたが現象は出ないので、ディスクキャッシュの消去と環境設定フォルダーの再設定を試してください。
また、GPUドライバーのアップデートも確認してください。
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/kb/cq02250244.html
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/kb/cq02250243.html

レンズフレアは、スクリーンで合成するよりも、下記の方法でレンズフレアの色や不透明度を変化させずに合成できます。
(1) エフェクト「レンズフレア」は、フッテージに適用する。
　「光源の位置」をトラッキングデータとリンクさせる。

(2) 平面に適用させる方法を使う時は、レンズフレアを適用後、アニメーションプリセット「明度からのアルファ（Unmult）」を適用する。
「通常」モードで合成する。

「明度からのアルファ」よりもVideo Copilotのプラグイン「Color Vibrance」（無料）の方が綺麗にアルファを切り抜けるので、インストールして下図のように設定してください。