アニメをつくる為にAPNGもしくはHEVCを使いたいです

＜追記＞
アルファチャンネル付きのHEVCは、現在はAppleだけのコーデックだと思います。
AppleのエンコードソフトCompressorで読み込んで、ProRes 4444アルファ付きに変換できる可能性があります。

ただ、macOS がCatalinaからの対応のため、Mojaveを使用しているMacではアルファチャンネル保持の選択ができないので確認はできていません。

下記の記事には、HEVCのアルファチャンネル保持の選択ができているスクリーンショットがアップされています。

HEVC video with Alpha channel in Compressor

現在のAfter Effectsは、APNGには対応していません。
また、HEVCに対応していますが、アプリの説明によるとアルファチャンネル付きのHEVCとなっているので、この方式だと対応していません。

PSDかPNGのどちらかになると思います。

あるいは、APNGからPNGへ変換できるアプリが存在すれば対応できるかもしれません。