オブジェクト全てがJPEGに置き換わってしまった。

スクリーンショットを拝見した限りは、JPEGファイルを直接Illustratorで開いた時、

または、aiファイルに単独でJPEGを埋め込みとして配置した場合、

もしくは、JPEGを直接開いた後に別名保存して再度開いた場合と同様に見えます。

タブ内で見えている拡張子は確かにaiなので、2または3の状態と同様と推測されます。

ただ、Illustrator内でJPEGファイルを生成できるのは書き出しの時だけですから、

aiファイルのまま、作成したオブジェクトに対して、JPEGファイルとして

明示してダイレクトに埋め込み画像にすることは本来は不可能なはずです。

そうなると、実際にどのような操作を行ったのかや、具体的な再現手順などを

見出すことがどうしても必要になってきます。

おそらく、現状はリンクパネルに、拡張子を含むファイル名も出ていると思いますが、

もしai内部でビットマップ化（ラスタライズ）した場合は、そのような情報は

下記のように一切表示されません。

あと念のためですが、aiファイルはどのように保存し、設定はどうされていたでしょうか。

またJPEGファイルとは別の名前でaiファイルを保存した場合はどうでしょうか。

いずれにしても、ひとつひとつの挙動としての、具体的な手順や設定内容を確認していただくのが

望ましいところだと思います（現状は正直なところ曖昧なためです）。