パワポ動画を素材に使うと、書き出した際ブレが発生する。

画像がブレて見えたのは、シーケンス設定にて「フィールド」が「奇数フィールドから」になっているのが原因の可能性が高いです。

そもそもYouTubeは,下記リンク先の公式情報（フレームレートの項目）にあります通り、インターレースに対応していません。

アップロードする動画におすすめのエンコード設定 (https://support.google.com/youtube/answer/1722171) 

ですので、フィールドを「なし」にしていただくと良いと思います。

厳密には、なしにすることで、インターレースで撮影された講師素材は少し画質が劣化（垂直解像度の低下）が見られると思うのですが、Premiere Proのみで作業を完結する場合には妥協せざるを得ない部分です。

Power Pointは音無しとのことですので、あまり深く気にしなくても大丈夫だと思いますので、とりあえずそのままお使いいただいて大丈夫かと思います。

（時間が厳密でなければ、フッテージを変換にて29.97fpsにする手もありますが、その意味があるかないかは状況によります。）

残念ながら

>たまに音声が抜け落ちているような箇所があるような気がしました。

という部分についてははっきりとしたことは分からず、偶発的なものかもしれませんので、とりあえず29.97fpsインターレース「なし」のシーケンスで音が消えたりしないか注意しつつ編集していただくのが無難なところかと思います。