全て60fpsで撮影した動画を編集する際のシーケンス設定

お書きになられている方法は、いずれも問題はありません。

60fpsで撮影して30fpsで編集し、ときおり50％スローにする場合、通常速度部分とスロー部分の映像の滑らかさが同じになるというメリットがあります。しかし逆に言えば、通常速度のシーンはせっかく60fpsの滑らかな映像なのに、半分の情報を捨てて滑らかさを損ねているとも言えます。

（とはいえ必ずしもフレームレートは高い方がよいわけでもなく、テレビドラマなどでは演出的に意図的に30pで撮ったり、多くのミュージックビデオは映画と同じ24pで制作されていたりもします。）

60fpsで撮影して60fpsで編集し、ときおり50％スローにする場合には、通常速度に比べるとスロー箇所が少し滑らかさに欠けるように見えると思います（あまり気にならないとは思いますが）。

この場合、補完方法を「オプチカルフロー」にすると、結構よい感じに滑らかになることも多いです。

私個人的には、日常の記録ビデオ的なものでしたら60fpsの方が見やすくてよいと思うのですが、多少パラパラとした動きの方が雰囲気が良いとお感じになる場合には30fpsをお選びいただければよいのではないかと思います。

（フレームレートが低いと、カメラの動きが多い時に起きる「映像酔い」をしやすくなることもあるので、少し注意が必要ですね。）

全くの余談ですが、最近の性能の良いテレビは勝手に動きを滑らかにする機能がついていたりしまして、30pで編集しても60pで編集しても、違いが分かりにくいことがあります（よく見ると、たまに補完に失敗して輪郭が崩れたりもします）。

映画を見ているのにニュースの一場面のような滑らかな映像になってしまい、逆に興ざめしてしまうなど、演出的にフレームレートを選んでいる制作者からすると大変腹立たしい余計な機能でもあります（苦笑）。