書き出しが行えない

ベータ版の使用がこの問題に影響しているか否かは分からないのですが、正常に書き出せるものもあるようですので、解決の方法はあるのではないかと思います。

状況を正確に把握するため、

>他の動画は問題なく書き出しが行えます。

こちらの「動画」とお書きいただいているものを詳しくお教えいただけますでしょうか。例えば、「別のプロジェクトファイルで編集しているシーケンス」ですとか、「同じプロジェクトファイル内の別のシーケンス」といった具合です。

その結果次第ではあるのですが、もし特定のシーケンスのみが書き出しできないようでしたら、問題の切り分けのため新規シーケンスを作成していただき、問題の起きるシーケンスの中身をすべてコピーして新規シーケンスに貼り付けたもので書き出しをお試しいただくといかがでしょうか。

（その際、シーケンスの設定は同じように設定してみてください。）

そしてもう一つお教えいただければと思うのですが、リンクを貼っていただいた画像では「シーケンス01_2.mp4」というファイル名で書き出しをしている状況ですが、このファイルの書き出しでエラーになっている状況でしょうか。

それとも、この書き出し設定の画像のファイルは正しく書き出しできていて、

>メイン_2.mp4 のファイル構造の矛盾が検出されました。このファイルのメタデータ (XMP) の読み書きはできません

こちらにお書きいただいた「メイン_2.mp4 」というファイルでの書き出しがうまくゆかない状況でしょうか。