macbook pro ハードウェアアクセラレーションはサポートされていません と表示されてしまいます

YouTube用プリセットでは問題がないようですので、不具合ではなかったようですね。

今問題になっているのは、「ハードウェアエンコーディング」でも時間がかかりすぎるということでしょうか。もしかすると、それは「エンコード（映像の圧縮工程）」ではなく「レンダリング（エフェクトなどの計算処理）」に時間がかかっているのかもしれません。

ビットレートを大幅に下げますと映像の品質に大きな影響が出てきますし、それに見合うエンコード時間の削減にはならないと思います。

どういった用途に映像をお使いになられるかに依りますので一概には言えませんが、「エンコード時間」を削減する場合、ビットレートを少し高めにして画質の劣化を抑えつつ、2passではなく1passを選ぶなど、エンコード時間と仕上がりのファイルサイズを天秤にかけるやり方も一つの方法かと思います。