「会社の管理者より、このグループへの参加申請が却下されました」とのメール受信について

グループ版のほうで管理者に対して利用申請処理を行った場合だと、グループ版で用意されているAdmin Consoleにアクセス可能な管理者に対して利用申請が行われ、管理者のほうでその申請却下をしたからではないかと思います。

一度管理者の方に確認されるのがいいでしょう。

また個人版の契約とのことですが、会社での利用と同じメールアドレスを利用されているでしょうか。

その場合にはログイン時に個人なのか法人なのかの確認画面が表示されるので、その選択によってIDの扱いが変わる状態になります。