画像をレイヤーとして開くという当たり前のことができない。

ajabonさんが書かれているとおりで，Photoshopではレイヤーとして画像ファイルを開くというより配置していく感じになりますね（下記）。

写真と画像を結合する  

Photoshopは写真を補正加工するためのアプリケーションとして生れました。個々画像について別ラインでの作業を想定しています。

そのワークフローからみれば、写真を同じファイル内に別レイヤーとして読み込むというのは「当たり前」ではないのです。

私はpremiereProについては存じませんが、「開く」からその挙動をするアプリケーションがあることを初めて知りました。

そのアプリケーションを使ってどのような作業をしたいのか、その挙動が致命的とまで思われるのであれば他のアプリケーションも検討されたほうがよいかもしれません。

根本的なおはなしですが、各アプリケーションが想定するワークフローは全く異なります。そして、Photohopがデフォルトでその様な挙動になると批判の嵐が巻き起こるでしょう。元来、画像を個々に操作する作業が主であり、別のファイルをレイヤーとして読み込む処理がメインになると使い勝手が大きく損なわれてしまうでしょう。

各アプリケーションのワークフローはそれぞれがターゲットとして想定する手順に最適化されされるべきものです。「こちらでの当たり前はあちらでの非常識」という事は当然あり得る事であり。ユーザーはそれぞれの特性を正しく理解してうまく使い分ける必要があります。