lnDesign の旧バージョン19.1をインストールする場合

InDesign20.xだけがインストールされている状態で19.1をインストールしようとしている感じですかね？

それと同じアラートを自分では見たことがないのですが，バージョンアップができなくなるという意味ではないと思います。「今後新しいパー ジョンで上書きされなくなります」で不安になりますけど，たぶん…，

「このバージョンのlnDesignをインストールすると，InDesignの自動更新設定が無効になるため，今後は新しいアップデータがリリースされても自動的にアップデートされなくなります。ご了承ください」

くらいの意味でしょう。自動更新されなくなるだけですね。

InDesignに限らず，Adobeアプリはアップデートで新機能の搭載とバグフィクスが行われる一方で「新しい不具合」がほとんど必ず発生しますから，業務で使う場合は自動更新オフがおすすめです。自動更新設定が無効になるのはよいことだと思います。