PDFで作った商品リストに、スマホでチェックマークを入れて使用したいのですが

スマホのほうでAcrobat Reader DCを利用していない場合は、そちらを使ってみてください。

また、利用される環境が表示アプリを指定できるならいいのですが、そうでない場合は運用はちょっと難しいように思います。

スマホで誰でも確実に、となるような場合、Webベースで作成した方が無難かもしれません。

作り方やトラブルの原因についてのご質問ですが，どういった環境・手順で作ったデータなのかがわからないと良い回答がつきにくいと思います。前提条件はより具体的であることが望ましいです。

少なくともOSのバージョン，商品リストを作ったアプリケーション名とそのバージョン，チェックボックスを作ったアプリケーション名とそのバージョン…などは必要な情報でしょうか。