掲示板のcgiファイルをダウンロードし、編集をかけると中身が変わるのか表示されなくなります。

nmatsuo5さんがおっしゃるように、昔からcgiの編集をDreamweaverで行う場合はBOMの有り無しで動作しなくなることがあります。

環境設定でBOMを含めたUnicodeのチェックを外すなどのテクニックが必要になります。

また、Forumに投稿される方に多いのですが、何の根拠もなく「バグ」と呼ぶのはやめましょう。

バグは、デバッガーやエンジニアがプログラムの不具合として認識するものであって、検証もせず単にユーザーの思い通り動作しない時の総称ではありません。

今回の場合はエラーではないでしょうか。

cgiの編集はご利用のサーバによって、文字コードや改行コード、ファイルの転送形式等気を付ける箇所が多数あるので、一概にどこに原因があるか特定するのが難しいです。まずは、シンプルなフリーのテキストエディタとFTPツールをご利用頂く方が無難です。