Problemas con archivos .mpg al volcarlos en la línea de tiempo se desincroniza audio y vídeo

Tengo un serio problema con archivos de extensión .mpg una vez los tengo importados pruebo a ver si están correctos y no hay problema alguno.... pero una vez que los vuelco en la línea de tiempo se desincroniza el audio y el vídeo. La solución que me da todo el mundo es que los renderice y los pase a .mp4... eso está bien cuando se trata de 1 ó 2 archivos, pero cuando se trabaja, como en mi caso con cientos de archivos eso resulta inviable. No quiero creer que Adobe no haya puesto solución a este problema que me consta tienen muchas personas que trabajan con archivos que tienen un cierto tiempo. 

Agradezco anticipadamente vuestras respuestas.