いくつかの観点があるのですが気になる部分で実施できそうなトラブルシューティングを記載しておきますー。
・Premirer Pro 25.3を使用している
→何かと最新版ではトラブルが起こることが多いのと「25.3」では最近別のバグ報告もされているので、一旦下のVerに下げて使用してみてください(マイナーVerの1個したでもメジャーVerの1個したでもいいです)
・aviファイル(640x480, 29.999fps, Rec. 709, プログレッシブ) →29.97fpsは主流ですが、29.999fpsというのは珍しいfpsです、AVIは様々なコーデックを梱包できるのでフリーソフトやキャプチャソフトでよく使われていますが、Premirer Pro自体は一般的にメジャーなカメラで撮影された映像で編集する事を想定されているため、相性が良くない素材というのがあります。
そういう場合はアドビではなく別ソフト等(フリーウェアのHandbreakが問題が少ない)で同じフォーマットでもいいので29.97fpsなどに変換してから使用してみてください。
(問題の切り分けのための手法となりfpsの変更による再生時の変化は考慮していませんのでご理解をお願いします)
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